EasyClus LIVE是一款流式細(xì)胞儀(CytoSense)文件專用軟件,可在儀器完成分析后,對數(shù)據(jù)進(jìn)行全程自主分析。該軟件能執(zhí)行各類操作流程,從儀器狀態(tài)校驗(yàn),到詳細(xì)的聚類分析與數(shù)據(jù)庫匹配均全面覆蓋。分析結(jié)果會(huì)同步至指定網(wǎng)站,實(shí)現(xiàn)對采樣天然水體及儀器狀態(tài)的近實(shí)時(shí)(約3分鐘內(nèi))報(bào)告呈現(xiàn)。
CytoSense結(jié)合EasyClus開展實(shí)時(shí)分析的核心目的,是實(shí)現(xiàn)對河流、湖泊或船舶上藻類的高頻實(shí)時(shí)監(jiān)測。它可提供浮游植物的動(dòng)態(tài)變化與當(dāng)前狀態(tài)信息,這類指標(biāo)往往在短時(shí)間內(nèi)就可能發(fā)生波動(dòng)。此外,該系統(tǒng)還可通過浮游植物群落的(突發(fā)性)變化,為水體化學(xué)污染情況提供參考信息。
本周,Thomas Rutten Projects為CytoSense用戶發(fā)布了升級的EasyClus v2.18版本。浮游植物(藻類)及其他顆粒的測量速度為每秒數(shù)百個(gè),所有這些數(shù)據(jù)和圖像都可以轉(zhuǎn)發(fā)到EasyClus(LIVE),以便進(jìn)一步將其歸類為藻類組或物種類型。
通過此次更新,用戶將獲得:
??更快的聚類和物種層級分組
??更直觀的工作流程處理高頻CytoSense數(shù)據(jù)
??實(shí)時(shí)浮游植物觀測模式改進(jìn)
??在水質(zhì)和生態(tài)系統(tǒng)監(jiān)測中提供更強(qiáng)有力的決策支持
澤泉科技致力于打造一個(gè)強(qiáng)大硬件與智能分析協(xié)同工作的生態(tài)系統(tǒng),從而提供更清晰、更快速、更具可靠性的結(jié)果。在流式細(xì)胞術(shù)領(lǐng)域,Cytosense AI正逐漸興起,該設(shè)備正在改變研究人員藻類現(xiàn)場監(jiān)測的方式,人工智能正在為細(xì)胞分析樹立新標(biāo)準(zhǔn),使其成為現(xiàn)代研究不可或缺的工具。EasyClus自動(dòng)聚類軟件基于龐大的數(shù)據(jù)集訓(xùn)練,采用機(jī)器學(xué)習(xí)算法以卓越的準(zhǔn)確度識別細(xì)胞群體間的細(xì)微差異,實(shí)現(xiàn)AI驅(qū)動(dòng)的數(shù)據(jù)分析,提供前所未有的準(zhǔn)確性和高效率。
自動(dòng)門控與分類:通過自動(dòng)輸入大量復(fù)雜門檻策略,實(shí)現(xiàn)即時(shí)數(shù)據(jù)分析
實(shí)時(shí)反饋與調(diào)整:Easyclus軟件持續(xù)從處理的數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí),每次使用都不斷優(yōu)化分析并提升準(zhǔn)確性。
數(shù)據(jù)可視化與報(bào)告:分析完成后,生成詳細(xì)的可視化和報(bào)告,即使是非專家也能輕松理解。
新增改進(jìn)功能:
1. 可直接在EasyClus中導(dǎo)入CytoClus的.xml 選區(qū)文件
使用CytoClus保存的.xml文件,即可在EasyClus的LASSO方法里完成物種聚類,無需依賴EasyClus自身數(shù)據(jù)庫。

或者:
數(shù)據(jù)庫可直接通過CytoClus保存的已聚類粒子.xml 文件填充。
打開數(shù)據(jù)庫模塊,選擇“Make dbs & CytoClus”選項(xiàng)即可。

選擇第二個(gè)選項(xiàng):“同時(shí)選擇原始.cyz 文件和CytoClus選區(qū)集 .xml”。

打開在 CytoClus 中已分配給各物種/類型的.cyz 文件及對應(yīng)的.xml文件(含文件名)。
設(shè)定要加入數(shù)據(jù)庫的每個(gè)物種/類型的最大粒子數(shù)。
選擇或新建一個(gè)空數(shù)據(jù)庫。
勾選需入庫的物種/類型,點(diǎn)擊“Make-Add to Database”完成添加

2. 涉及 *.idnrs.mat 與 *.txt 結(jié)果文件的菜單已擴(kuò)展,現(xiàn)支持更多聚類算法產(chǎn)生的結(jié)果文件。
聚類結(jié)果的導(dǎo)出(及整理)由下方提到的導(dǎo)出模塊完成(見下文)。

聚類輸出文件的選擇取決于所使用的方法;系統(tǒng)會(huì)通過過濾器篩選不同聚類方法生成的結(jié)果?,F(xiàn)已在此新增若干額外過濾器。

3. 正確微珠的選擇界面已擴(kuò)充,新增菜單可設(shè)定更精細(xì)的篩選條件
例如:
最低必需粒子數(shù)
Orange 微珠的最小/最大值
Yellow 微珠的最小/最大值
流式細(xì)胞儀應(yīng)定期用穩(wěn)定的標(biāo)準(zhǔn)熒光微珠進(jìn)行校驗(yàn)。
系統(tǒng)找到的“微珠簇”結(jié)果會(huì)自動(dòng)寫入(長期)校準(zhǔn)圖(Shewart 圖),記錄每次檢測中各探測器對應(yīng)的微珠簇平均值。
在 EasyClus 中,這一切由“Find my beads”工具自動(dòng)完成;但微珠的特征參數(shù)需根據(jù)您實(shí)際使用的熒光微珠類型以及儀器探測器設(shè)置(PMT 電壓)手動(dòng)添加或調(diào)整。

參數(shù)可通過一個(gè)全新、更清晰的菜單進(jìn)行調(diào)節(jié),并附帶“測試”按鈕。
若系統(tǒng)內(nèi)偶爾殘留第二群微珠(未完全沖洗干凈),需將其排除在真實(shí)校準(zhǔn)微珠設(shè)定之外。
校準(zhǔn)圖應(yīng)呈現(xiàn)近似水平線,表明儀器狀態(tài)穩(wěn)定。
藍(lán)色區(qū)域:調(diào)整參數(shù)并測試;
綠色區(qū)域:將設(shè)定保存至三種不同微珠類型。
最近一次使用的設(shè)定將被默認(rèn)為“Find my beads”功能的執(zhí)行依據(jù)。

4. 新增 FTP 上傳/下載功能
可在兩臺(tái)電腦之間(經(jīng)互聯(lián)網(wǎng))互傳文件,或直接發(fā)送至 Thomas Rutten Projects;
單次傳輸總量限 <10 GB。


紅色選項(xiàng):將文件上傳至 Thomas Rutten Projects 服務(wù)器(臨時(shí)存儲(chǔ)),然后你可以通過另一臺(tái)電腦下載,下載后文件將從服務(wù)器上刪除。
綠色選項(xiàng):將文件上傳至 Thomas Rutten Projects 服務(wù)器(臨時(shí)存儲(chǔ)),僅 TRP(Thomas Rutten Projects)可下載該文件,用于進(jìn)一步研究、咨詢或其他用途。

5. 其他功能改進(jìn):
表格可視化中的“最大值”一列原先實(shí)際顯示的是“總計(jì)”,現(xiàn)已修正為真正的最大值。
聚類結(jié)果會(huì)以表格形式展示各類特征,其中“最大值”字段已更正

聚類完成后,可通過散點(diǎn)圖界面上的一個(gè)按鈕激活并查看該表格。

或者通過菜單中的“報(bào)告”按鈕也可以打開該表格。
點(diǎn)擊綠色圓圈按鈕,你可以立即查看某個(gè)聚類中的圖像!

